核酸質譜之漫話二: 核酸質譜法鑒定結核病及其耐藥性
摘要
結核病是嚴重威脅人類健康的重要傳染性疾病之一。如何準確快速診斷和鑒別診斷結核病及其耐藥性,對指導臨床開展早期精準有效治療至關重要。本篇主要介紹核酸質譜技術在鑒定結核病及其耐藥性方面的內容…
結核病是嚴重威脅人類健康的重要傳染性疾病之一。如何準確快速診斷和鑒別診斷結核病及其耐藥性,對指導臨床開展早期精準有效治療至關重要。本篇主要介紹核酸質譜技術在鑒定結核病及其耐藥性方面的內容…

結核病是嚴重威脅人類健康的重要傳染性疾病之一。來自世界衛生組織的數據顯示:2021年全球有1060萬例新發結核病患者,死亡近160萬例,新增45萬例耐多藥/利福平耐藥結核病患者;我國新發78萬例結核病患者,新增耐多藥/利福平耐藥結核病患者約3.3萬例,是全球結核病及耐藥結核病高負擔國家之一;肺外結核占所有結核病的15%~40%,因其容易導致器官或組織功能性損傷和器質性障礙而成為近年來結核病領域關注的重點(數據摘自《中國防癆雜志》)。
因此,準確快速診斷和鑒別診斷結核病及其耐藥性,對指導臨床開展早期精準有效治療至關重要。
常見的結核病及其耐藥性的診斷方法
目前對診斷結核病及其耐藥性的方法有:實時熒光定量PCR技術、恒溫擴增技術、基因芯片/線性探針技術、基因測序技術和核酸質譜技術等。
核酸質譜技術鑒定結核分枝桿菌的優勢

目前,核酸質譜技術可鑒定結核分枝桿菌復合群8個亞種和40個非分枝桿菌菌種及其亞種,合計48個分枝桿菌菌種和亞種,幾乎覆蓋了臨床上分枝桿菌病的所有常見致病菌。而對于分枝桿菌的保守基因片段,核酸質譜技術可以針對基因的多態性進行設計和鑒定。其優勢如下:
1)敏感度高:目前核酸擴增技術的結核分枝桿菌檢測均基于IS6110、IS1081等位點進行擴增,選擇其中的1個或2個,而核酸質譜技術可在此基礎上增加其他位點的多肽性檢測;
2)特異性高:核酸質譜可以用多基因結果驗證,保證結核分枝桿菌檢測的特異度;
3)耐藥性檢測方面應用范圍廣:幾乎覆蓋了目前常用的抗結核和抗分枝桿菌病的藥物,檢測針對性強、準確性高;
4)檢測速度快:近百例樣本同時進行檢測分析,檢測周期短于一代和二代測序,對少量樣本也能進行多基因多位點檢測。無需培養,實現單個核苷酸堿基的直接鑒定。
核酸質譜技術鑒定結核分枝桿菌抗結核藥物
目前核酸質譜技術可檢測結核分枝桿菌4種一線抗結核藥物(異煙肼、利福平、吡嗪酰胺和乙胺丁醇)和常用的二線抗結核藥物(氟喹諾酮類、鏈霉素等)的耐藥基因型。藥物的檢測結果與表型藥物敏感性(簡稱“藥敏”)試驗結果具有很好的一致性;并可根據耐藥相關的基因多態性進行設計,從而獲得相關的耐藥基因突變結果??捎糜跈z測常用一線、二線抗結核藥物的耐藥基因位點。如利福平和異煙肼等。
* 利福平:利福平的耐藥決定區集中了95%以上的臨床耐藥菌株。核酸質譜技術能夠檢測出此決定區的所有突變位點,以及區外的常見位點,從而較全面地預測利福平耐藥性。同時,核酸質譜法檢測的結果還會提示是低水平耐藥還是高水平耐藥,從而避免出現使用藥敏方法檢測時的遺漏。
綜上所述:對于結核病的診斷,我國主要通過患者的臨床表現、影像學檢查結果及免疫學檢測結果進行綜合分析,但缺點是檢測時間長及準確率有待提高。近年來,分子診斷技術包括核酸質譜技術的迅速崛起和發展,為結核病的快速診斷提供了新的方法。

東西分析經過數年的開發,基于飛行時間質譜技術平臺開發出快速鑒定結核分枝桿菌及其抗結核藥物的應用方案?;谟脩舻木唧w需求,通過核酸質譜這個快速及強有力的輔助診斷工具,東西分析可對結核分枝桿菌進行精確到種乃至亞種水平的鑒定,從而為臨床提供早期精準診斷和治療參考建議。對于陽性的檢測結果,還可進一步進行耐藥性檢測。即根據檢測結果,臨床醫生不僅能夠進行高效精準的結核病診斷,還能夠及時調整治療藥物,從而優化治療方案。

Ebio Reader 3700 Plus 飛行時間質譜儀